Die Musiksammlung umfasst handschriftliche und gedruckte Werke von Komponisten und Komponistinnen, die in Schleswig-Holstein geboren wurden, hier gelebt oder gewirkt haben. Dazu zählen etwa Carl Maria von Weber, Carl Reinecke, Cornelius Gurlitt, Felix Woyrsch oder Arnold Maury. Ebenfalls gesammelt werden Kompositionen zu Texten schleswig-holsteinischer Dichter und Dichterinnen wie Theodor Storm, Klaus Groth, Emanuel Geibel, Friedrich Hebbel oder Sarah Kirsch. Einen weiteren Sammelschwerpunkt bilden Lieder und Liederbücher, basierend auf den umfangreichen Schenkungen der Liederbuchsammlung von Edmund Lehmann und dem „Schleswig-Holsteinischen Volksliedarchiv“ von Max Kuckei.

Darüber hinaus werden in der Handschriftensammlung der Landesbibliothek auch Nachlässe und Teilnachlässe von Musikern und Komponisten verwahrt (beispielsweise von Jens Rohwer oder Hermann Stange), aber auch von Musikwissenschaftlern und -wissenschaftlerinnen (Kurt Gudewill, Wilhelm Pfannkuch, Anna Amalie Abert, Theodora Holm).